В 1979 году произошло воссоединение творческого тандема Элтона Джона и Берни Топина. В следующем году вышел в свет новый альбом 21 at 33, который считается большим достижением в творческой карьере певца. Одной из песен, вошедших в альбом, была композиция Little Jeannie, которая стала самой большой удачей Элтона Джона за четыре года. Она поднялась на 3 позицию в хит-параде США. Следует однако заметить, что стихи для этой песни были написаны Гари Осборном. Помимо Топина и Осборна Элтон Джон сотрудничает в этот период с такими авторами стихов как Том Робинсон и Джуди Тсуки.
В 1981 году выходит альбом The Fox, запись которого проходила частично во время записи предыдущего альбома. В этой работе принали участие оба поэта — Топин и Осборн. 13 сентября 1980 года Элтон Джон дает бесплатный концерт перед толпой поклонников примерно в 400 000 человек в Центральном парке Нью-Йорка. Концерт проходил в непосредственной близости от дома, в котором располагалась квартира Джона Леннона, друга Элтона Джона. На этим концерте Элтон Джон спел песни Imagine, в качестве посвящения своему другу. Через три месяца Леннон был убит возле этого самого здания. Элтон Джон оплакивает эту потерю в своей композиции 1982-го года Empty Garden (Hey Hey Johny), вошедшую в альбом Jump Up! В августе 1982 года Элтон Джон принял участие в концерте посвященному памяти Джона Леннона, который состоялся в концертном зале Мэдисон-Сквер-Гарден в Нью-Йорке. На сцене к певцу присоединились Йоко Оно и Шон Оно Леннон, крестный сын Элтона Джона.
80-е годы стали периодом сильных личных потрясений для певца. В 1984 году, он неожиданно для многих, женился на звукоинженере Ренате Блауэл. В 1986 году он теряет свой голос во время турне по Австралии и вскоре после этого переносит операцию на горле. С его голосовых связок было удалено несколько полипов, которые к счастью не были связаны с онкологией. В результате этого тембр голоса певца несколько изменился, и с этого периода он начинает звучать по новому. Элтон Джон продолжает активно записываться, однако годы пристрастия к кокаину и алкоголю начинают давать о себе знать. В 1987 году он выигрывает иск в клевете к газете The Sun, которая обвинила его в том, что он занимается сексом с несовершеннолетними. После своей победы в суде Элтон Джон сказал: «Вы можете называть меня толстой, лысой, бесталанной старой королевой, которая не умеет петь — но вы не имеете права говорить про меня неправду».
После того, как прежние члены его группы, такие как Джонстон, Мюррей и Олссон собрались снова вместе, Элтон Джон смог вернуться в ведущие хит-парады со своим новым альбомом To Low For Zero, который был записан в 1983 году. Этот альбом, помимо других песен, включал в себя такие хиты как I'm Still Standing и I Guess That's Why They Call It The Blues. Последняя композиция, в записи которой принял участие Стиви Уандер, достигла 4-го места в американских хит-парадах. Несмотря на то, что Элтону Джону в этот период так и не удалось повторить тот успех в Америке, которого он достиг в 70-е годы, его песни регулярно попадали на высшие позиции в хит-парадах на протяжении всего десятилетия. Это были такие композиции как: Little Jeanny (заняла 3 место в 1980 году), Sad Song (Say So Much) (5 место в 1984), Nikita (7 место в 1986). Наиболее успешным синглом стала рабора, в которой Элтон Джон принимал участие на ряду с такими артистами как Дайон Уорвик, Глэдис Ннайт и Стиви Уандер — That's What Friends Are For (1 место в 1985 году). Доходы от этой песни пошли на финансирование исследование связанных со СПИДом. Несмотря на то, что его альбомы продолжают продаваться, только такая его работа как Reg Strikes Back сумела пробиться в американский Топ-20 и занять там 16 место в 1988 году.
В 1984 году футбольный клуб Уотфорд пробился в финал кубка английской футбольной лиги. Таким образом осуществилась давнишняя мечта Элтона Джона, который на протяжении многих лет был поклонником этого клуба, а так же его владельцем и главой правления. Во время традиционной предматчевой церемонии, поклонники пели песню Abide With Me, что вызвало слёзы на глазах Элтона Джона. Однако, игра была проиграна клубу Эвертон, который играл в традиционной для себя голубой форме. После игры болельщики Эвертона подняли над своей трибуной транспарант с надписью: «Прости, Элтон — но это наверно то, почему все называют нас голубыми».
В 1985 году Элтон Джон, на ряду с другими известными исполнителями, принял участие в концертном проекте Live Aid, сборы от которого были направлены на помощь странам африканского континента. Во время концерта-марафона на стадионе Уэмбли в Лондоне он исполнил свои песни Bennie And The Jets и Rocket Man, спел Don't Go Breaking My Heart вместе с Кики Ди, а так же представил широкой публике, своего молодого друга Джорджа Майкла, бывшего тогда еще членом групы Wham!, спев с ним песню Don't Let The Sun Go Down On Me.