В 1994 году Элтон Джон совместно с Тимом Райсом принял участия в работе над музыкой к анимационному фильму компании Дисней Король Лев. Фильм стал самым комерчески успешным рисованным мультфильмом всех времён, и песни, записанные для него, сыграли в этом не последнюю роль. Из пяти песен номинированных на премию Оскар в этом году, три были написаны Элтоном Джоном и Тимом Райсом для Короля Льва. Песня Can You Feel The Love Tonight выиграла премию Оскар. С этой песне Элтон Джон был удастоин так же премии Грэмми в номинации Лучший мужской поп-вокал. Саундтрек к фильму продержался на первом месте в чарте журнала Billboard девять недель. 10 ноября 1999 года RIAA объявила, что продажи альбома The Lion King достигли 15 миллионов и он таким образом с большим запасом завоевал статус «бриллиантового», согласно классификации этой организации.
В 1994 году, Элтон Джон был введен в Зал славы рок-н-ролла, до этого, в 1992 году, он и Берни Топин стали членами Зала славы авторов песен. В 1995 году он стал Командором Ордена Британской Империи. Элтону Джону был дарован титул рыцаря-бакалавра, что дало ему право добавлять приставку «сэр» к своему имени.
В 1995 году выходит его альбом Made In England, который занимает 3-ю позицию в британском хит-параде. Одна из композиций из этого альбома — Believe так же попадает в чарты и занимает там 15-ю позицию. В следующем году выходит сборный альбом Love Songs.
1997 был отмечен для Элтона Джона взлётами и неприятностями. В начале года певец предстал перед публикой во свем своем «блеске» во время празднования своего 50-ти летнего юбилея. Он организовал празничную вечеринку для 500 наиболее близких друзей в стиле Людовика IV, на которой появился в костюме стоимостью $80 000. 17 января 1997 года он принял участие с тремя оставшимеся членами группы Queen в Париже в церемонии открытия концертной программы «Le Presbytere N’a Rien Perdu De Son Charme Ni Le Jardin Du Son Eclat» легенды французского балета Мориса Бежара, которая была посвящена борьбе со СПИДом и памяти Фредди Меркьюри и Жорже Донна, звезде труппы Бежара. Это представление было вторым случаем после смерти Фредди Меркьюри, когда остальные члены группы собрались вместе. В конце 1997 кода, Элтон Джон потерял двух очень близких друзей: дизайнера Джанни Версачи (который был убит) и принцессу Диану, которая погибла в Париже в результате автомобильной катастрофы.
В начале сентября Берни Топин доработал стихи песни Candle In The Wind для специальной церемонии посвященной смерти Дианы и Элтон Джон спел её во время погребальной церемонии в Вестминстерском аббатсве. Запись этой песни стала самым быстро- и хорошопродоваемым синглом в истории поп-музыки. Общие продажи только на территории Великобритании достигли 5 миллионов копий, в США — 11 миллионов, а всего мировые продажи составили около 33 миллионов копий. Прибыли от продаж этого диска, которые составили примерно ?55 миллионов, были направлены в Мемориальный фонд Принцессы Дианы. В последствии певец получил с этой песней премию Грэмми в номинации Лучший мужской поп-вокал. Он никогда больше не исполнял этот вариант песни, неоднократно подчеркивая, что эта песня может быть исполненна только один раз, чтобы оставаться особенной.
В 1998 году выходит диск с записью музыки к мюзиклу Аида (Elaborate Lives: The Legend of Aida), над которым Элтон Джон работал встесте с Тимом Райсом. Первое сценическое представление этот мюзикл имел в Атланте, позднее представления прошли в Чикаго и на Бродвее в Нью-Йорке.

Первое десятилетие XXI-го века было отмечено для Элтона Джона многочисленными совместными работами с другими артистами и деятелями современной поп-культуры. В 2000 Элтон Джон и Тим Райс объединились снова, для работы над музыкой к новому анимированному фильму «Дорога на Эль-Дорадо». В этом году выходит диск с записью его концерта Elton John One Night Only – The Greatest Hits, который прошел за год до этого в концертном зале Мэдисон-Сквер-Гарден в Нью-Йорке.
В 2001 году Элтон Джон сделал заявление, что Songs From The West Coast, станет его последним студийным альбомом, и что с этого момента он будет сконцентрирован только на живых представлениях. Однако в 2004 году вышел его очередной студийный альбом — Peach Road.